In dit artikel worden twee basische aminozuren, glycine (Gly) en alanine (Ala), geïntroduceerd.Dit komt vooral omdat ze kunnen fungeren als basisaminozuren en het toevoegen van groepen eraan andere soorten aminozuren kan genereren.
Glycine heeft een bijzondere zoete smaak, dus de Engelse naam komt van het Griekse glykys (zoet).De Chinese vertaling van glycine heeft niet alleen de betekenis van "zoet", maar heeft ook een vergelijkbare uitspraak, die het model van "trouw, prestatie en elegantie" kan worden genoemd.Vanwege de zoete smaak wordt glycine vaak gebruikt als smaakstof in de voedingsindustrie om de bitterheid weg te nemen en de zoetheid te verhogen.De zijketen van glycine is klein met slechts één waterstofatoom.Dat maakt hem anders.Het is een basisch aminozuur zonder chiraliteit.
Glycine in eiwitten wordt gekenmerkt door zijn kleine formaat en flexibiliteit.De driestrengige helixconformatie van collageen is bijvoorbeeld heel bijzonder.Er moet één glycine per twee residuen aanwezig zijn, anders veroorzaakt het te veel sterische hinder.Op soortgelijke wijze vereist de koppeling tussen twee domeinen van een eiwit vaak glycine om conformationele flexibiliteit te verschaffen.Als glycine echter flexibel genoeg is, is de stabiliteit ervan noodzakelijkerwijs onvoldoende.
Glycine is een van de spoilers tijdens de vorming van α-helix.De reden is dat de zijketens te klein zijn om de conformatie überhaupt te stabiliseren.Bovendien wordt glycine vaak gebruikt om bufferoplossingen te bereiden.Degenen onder u die elektroforese doen, herinneren zich dat vaak.
De Engelse naam alanine komt van het Duitse aceetaldehyde, en de Chinese naam is gemakkelijker te begrijpen omdat alanine drie koolstofatomen bevat en de chemische naam alanine is.Dit is een eenvoudige naam, net als het karakter van het aminozuur.De zijketen van alanine heeft slechts één methylgroep en is iets groter dan die van glycine.Toen ik de structuurformules voor de overige 18 aminozuren tekende, voegde ik groepen toe aan alanine.In eiwitten is alanine als een baksteen, een veelgebruikt basisbouwmateriaal dat met niemand in conflict komt.
De zijketen van alanine heeft weinig hinder en bevindt zich in de α-helix, wat een conformatie is.Het is ook zeer stabiel als het β-gevouwen is.Als je bij eiwitengineering een aminozuur wilt muteren zonder een specifiek doelwit op een eiwit, kun je het over het algemeen muteren in alanine, wat niet gemakkelijk is om de algehele conformatie van het eiwit te vernietigen.
Posttijd: 29 mei 2023