Celpenetrerende peptiden zijn kleine peptiden die gemakkelijk het celmembraan kunnen binnendringen.Deze klasse moleculen, vooral CPP's met targetingfuncties, is veelbelovend voor een efficiënte medicijnafgifte aan doelcellen.
Daarom heeft het onderzoek ernaar een zekere biomedische betekenis.In deze studie werden CPP's met verschillende transmembraanactiviteiten op sequentieniveau bestudeerd, waarbij werd geprobeerd de factoren te achterhalen die de transmembraanactiviteit van CPP's beïnvloeden, de sequentieverschillen tussen CPP's met verschillende activiteiten en niet-CPP's, en een methode te introduceren voor het analyseren van biologische sequenties.
CPP's en NonCPPs-sequenties werden verkregen uit de CPP-site-database en verschillende literatuur, en transmembraanpeptiden (HCPP's, MCPP's, LCPP's) met hoge, gemiddelde en lage transmembraanactiviteit werden uit de CPPs-sequenties geëxtraheerd om gegevenssets te construeren.Op basis van deze datasets zijn de volgende onderzoeken uitgevoerd:
1. De aminozuur- en secundaire structuursamenstelling van verschillende actieve CPP's en niet-CPP's werden geanalyseerd met ANOVA.Er werd gevonden dat de elektrostatische en hydrofobe interacties van aminozuren een belangrijke rol speelden in de transmembraanactiviteit van CPP's, en dat de spiraalvormige structuur en willekeurige spiraalvorming ook de transmembraanactiviteit van CPP's beïnvloedden.
2. De fysische en chemische eigenschappen en lengtes van CPP's met verschillende activiteiten werden weergegeven op het tweedimensionale vlak.Er werd vastgesteld dat CPP's en NonCPP's met verschillende activiteiten konden worden geclusterd onder een aantal speciale eigenschappen, en HCPP's, MCPP's, LCPP's en NonCPP's werden verdeeld in drie clusters, wat hun verschillen laat zien;
3. In dit artikel wordt het concept van fysisch en chemisch zwaartepunt van biologische sequentie geïntroduceerd, en de residuen waaruit de sequentie bestaat, worden beschouwd als deeltjespunten, en de sequentie wordt geabstraheerd als een deeltjessysteem voor onderzoek.Deze methode werd toegepast op de analyse van CPP's door CPP's met verschillende activiteiten op het 3D-vlak te projecteren met behulp van de PCA-methode, en er werd vastgesteld dat de meeste CPP's samen clusterden en sommige LCPP's samen met niet-CPP's.
Deze studie heeft implicaties voor het ontwerp van CPP's en het begrijpen van de verschillen in de sequenties van CPP's met verschillende activiteiten.Bovendien kan de analysemethode van het fysische en chemische zwaartepunt van biologische sequenties die in dit artikel wordt geïntroduceerd, ook worden gebruikt voor de analyse van andere biologische problemen.Tegelijkertijd kunnen ze worden gebruikt als invoerparameters voor sommige biologische classificatieproblemen en spelen ze een rol bij patroonherkenning.
Posttijd: 15 juni 2023