I. Samenvatting
Peptiden zijn speciale macromoleculen, zodat hun sequenties ongebruikelijk zijn wat betreft hun chemische en fysieke kenmerken.Sommige peptiden zijn moeilijk te synthetiseren, terwijl andere relatief eenvoudig te synthetiseren zijn, maar moeilijk te zuiveren.Het praktische probleem is dat de meeste peptiden enigszins oplosbaar zijn in waterige oplossingen, dus bij onze zuivering moet het overeenkomstige deel van het hydrofobe peptide worden opgelost in niet-waterige oplosmiddelen. Daarom zijn deze oplosmiddelen of buffers waarschijnlijk ernstig inconsistent met het gebruik ervan. van biologische experimentele procedures, zodat het technici ten strengste verboden is het peptide voor hun eigen doeleinden te gebruiken, zodat de volgende verschillende aspecten van het ontwerp van peptiden voor onderzoekers volgen.
Ontwerpschema en oplossing van polypeptidepeptideketen
Ten tweede de juiste keuze van synthetische moeilijke peptiden
1. Totale lengte van naar beneden gereguleerde sequenties
Peptiden met minder dan 15 residuen zijn gemakkelijker te verkrijgen omdat de grootte van het peptide toeneemt en de zuiverheid van het ruwe product afneemt.Omdat de totale lengte van de peptideketen groter wordt dan 20 residuen, is de precieze producthoeveelheid een belangrijk aandachtspunt.Bij veel experimenten is het gemakkelijk om onverwachte effecten te verkrijgen door het residugetal onder de 20 te brengen.
2. Verlaag het aantal hydrofobe residuen
Peptiden met een groot overwicht aan hydrofobe residuen, vooral in het gebied 7-12 residuen van de C-terminus, veroorzaken gewoonlijk synthetische problemen.Dit wordt juist als een ontoereikende combinatie gezien omdat bij de synthese een B-gevouwen vel ontstaat.“In dergelijke gevallen kan het nuttig zijn om meer dan twee positieve en negatieve residuen om te zetten, of om Gly of Pro in het peptide te stoppen om de peptidesamenstelling te ontsluiten.”
3. Downregulatie van “moeilijke” residuen
"Er zijn een aantal Cys-, Met-, Arg- en Try-residuen die over het algemeen niet gemakkelijk worden gesynthetiseerd."Ser zal doorgaans worden gebruikt als een niet-oxidatief alternatief voor Cys.
Ontwerpschema en oplossing van polypeptidepeptideketen
Ten derde: verbeter de juiste keuze van oplosbaar in water
1. Pas het N- of C-eindpunt aan
Ten opzichte van zure peptiden (dat wil zeggen negatief geladen bij pH 7), wordt acetylering (acetylering aan de N-terminus, C-terminus waarbij altijd een vrije carboxylgroep behouden blijft) in het bijzonder aanbevolen om de negatieve lading te vergroten.Voor basische peptiden (dat wil zeggen positief geladen bij pH 7) wordt echter vooral aminering (vrije aminogroep aan de N-terminus en aminering aan de C-terminus) aanbevolen om de positieve lading te vergroten.
2. Verkort of verleng de reeks aanzienlijk
Sommige van de sequenties bevatten een groot aantal hydrofobe aminozuren, zoals Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr en Ala, enz. Wanneer deze hydrofobe resten de 50% overschrijden, zijn ze gewoonlijk niet gemakkelijk op te lossen.Het kan nuttig zijn om de sequentie te verlengen om de positieve en negatieve polen van het peptide verder te vergroten.De tweede optie is het downreguleren van de grootte van de peptideketen om de positieve en negatieve polen te vergroten door de hydrofobe residuen te downreguleren.Hoe sterker de positieve en negatieve kanten van de peptideketen, hoe waarschijnlijker het is dat deze met water reageert.
3. Voeg een in water oplosbaar residu toe
Voor sommige peptideketens kan de combinatie van enkele positieve en negatieve aminozuren de wateroplosbaarheid verbeteren.Ons bedrijf raadt aan om de N-terminus of C-terminus van zure peptiden te combineren met Glu-Glu.Het N- of C-uiteinde van het basische peptide werd gegeven en vervolgens Lys-Lys.Als de geladen groep niet kan worden geplaatst, kan Ser-Gly-Ser ook in het N- of C-uiteinde worden geplaatst.Deze aanpak werkt echter niet als de zijkanten van de peptideketen niet kunnen worden veranderd.
Posttijd: 12 mei 2023